Ribzymy

Jakie są rybzymy?

Ribzymy Są to RNA (kwas rybonukleinowy) o zdolności katalitycznej, która może przyspieszyć reakcje chemiczne występujące w organizmie. Niektóre rybzymy mogą działać samodzielnie, podczas gdy inne potrzebują obecności białka do katalizy.

Rybzymy odkryte do tej pory uczestniczą w reakcjach wytwarzania cząsteczek transferowych RNA i w reakcjach Splicing: Transteriacja, która uczestniczy w eliminacji intronów z cząsteczek RNA, przekażu, przeniesienia lub rybosomalnego. W zależności od ich funkcji są one podzielone na pięć grup.

Odkrycie rybzymów wzbudziło zainteresowanie wielu biologów. Te katalityczne RNA zostały zaproponowane jako potencjalny kandydat do cząsteczek, które prawdopodobnie spowodowały pierwsze sposoby życia.

Ponadto wiele wirusów używa RNA jako materiału genetycznego, a wiele z nich jest katalitycznych. Dlatego rybzymy oferują możliwości tworzenia narkotyków, które starają się atakować te katalizatory.

Charakterystyka katalizy

- Ribzymy są katalitycznymi cząsteczkami RNA zdolnymi do przyspieszenia reakcji przenoszenia grupy fosforylowej w rzędach wielkości 10⁵ do 10^jedenaście.

- W eksperymentach laboratoryjnych udowodnili również, że uczestniczą w innych reakcjach, takich jak transterifikacja fosforanu.

Rodzaje rybzymów

Istnieje pięć klas lub rodzajów rybzymów: trzy z nich uczestniczą w reakcjach samokontroli, podczas gdy pozostałe dwie (rybonukleaza P i rybosomalne RNA) używają innego substratu w reakcji katalitycznej reakcji katalitycznej.

Innymi słowy, cząsteczka inna od katalitycznego RNA.

Grupa I INTRONY

Ten rodzaj intronów stwierdzono w mitochondrialnych genach pasożytów, grzybów, bakterii, a nawet wirusa (takich jak bakteriofaga T4).

Na przykład w pierwotniakach gatunku Tetrahymena termofila, Intron jest eliminowany z prekursora rybosomalnego RNA w serii etapów: po pierwsze, nukleotyd lub nukleozyd guanozyny reaguje z wiązaniem fosfodiestrowym, które łączy intron z transssonem transcensualnym-.

Następnie wolny ekson dokonuje tej samej reakcji w ogniw fosfodi-intrón eksonu na końcu grupy akceptorowej intronowej.

Introny grupy II

Intony grupy II są znane jako „samowystarczalność”, ponieważ te RNA są zdolne do samodzielnego sezonowania. Intony tej kategorii znajdują się w prekursorach mitochondrialnego RNA w linii grzybów.

Grupy I i II i rybonukleazy P są rybzymami charakteryzującymi się dużymi cząsteczkami, możliwością osiągnięcia długości do kilkuset nukleotydów i tworzenia złożonych struktur i tworzenia złożonych struktur.

Introny grupy III

Intony grupy III są nazywane „autokoralnym” RNA i zostały zidentyfikowane w patogenach warzywnych.

Te RNA mają szczególność bycia w stanie przeciąć się w reakcji dojrzewania genomowych RNA, na podstawie prekursorów z wieloma jednostkami.

W tej grupie jest jednym z najpopularniejszych i badanych rybzymów: głowica młotka Ribozum. Występuje to w zakaźnych środkach rybonukleowych warzyw, zwanych wiroloidami.

Agenci te wymagają, aby proces esecision w celu rozprzestrzeniania się i wytwarzania kilku kopii w ciągłym łańcuchu RNA.

Wiroidy należy oddzielić od siebie, a reakcja ta jest katalizowana przez sekwencję RNA znalezioną po obu stronach regionu Unii.

Jedną z tych sekwencji jest „głowa młotka” i jest zatem nazywana podobieństwo jej wtórnej struktury do tego instrumentu.

Rybonukleaza p

Czwarty typ rybzymów powstaje zarówno przez cząsteczki RNA, jak i białka. W rybonukleach struktura RNA jest niezbędna do przeprowadzenia procesu katalitycznego.

W środowisku komórkowym rybonukleaza P działa tak samo jak katalizatory białkowe, przecinając prekursory RNA transferu w celu wygenerowania dojrzałego końca 5 '.

Ten kompleks jest w stanie rozpoznać powody, których sekwencje nie zmieniły się w trakcie ewolucji (lub bardzo niewiele się zmieniły) prekursorów transferu RNA.

Aby zjednoczyć podłoże z rybzymem, nie wykorzystuje ono komplementarności między zasadami.

Różnią się od poprzedniej grupy (Ribzymes Hammer Head), a RNA podobny do tego, końcowym produktem cięcia: rybonukleaza wytwarza 5 -calowy koniec fosforanowy.

Rybosom bakteryjny

Badania struktury rybosomów bakterii pozwoliły nam stwierdzić, że ma ona również właściwości rybzymu. Witryna odpowiedzialna za kataliza znajduje się w podjednostce 50s.

Ewolucyjne implikacje rybzymów

Odkrycie RNA o zdolnościach katalitycznych spowodowało hipotezę związane z pochodzeniem życia i jego ewolucją w początkowej stadiach.

Ta cząsteczka jest podstawą hipotezy „prymitywnego świata RNA”. Kilku autorów popiera domniemanie, że miliardy lat temu życie musiało zacząć od pewnej cząsteczki, która miała zdolność do katalizowania własnych reakcji.

Zatem rybzymy wydają się być potencjalnymi kandydatami do tych cząsteczek, które powstały w pierwszych sposobach życia.

Bibliografia

1. Devlin, t. M. Biochemia: podręcznik z aplikacjami klinicznymi. Odwróciłem się.
2. Strobel, s. DO. Rybozym/katalityczny RNA. Encyklopedia biologii molekularnej.
3. Voet, d., Voet, J. G., & Pratt, C. W. (2014). Podstawy biochemii. Wyd. Pan -american Medical.