Izomeraza Czym jest, funkcje, nomenklatura, typy

Izomeraza Są to klasa enzymów biorących udział w strukturalnym lub pozycyjnym rearglo izomerów i stereoizomerów różnych cząsteczek. Są one praktycznie obecne we wszystkich organizmach komórkowych, wypełniając funkcje w różnych kontekstach.

Enzymy tej klasy działają na pojedynczym podłożu, chociaż niektóre mogą być kowalencyjnie związane z kofaktorami, jonami, między innymi. Dlatego ogólną reakcję można zobaczyć w następujący sposób:

X-y → Y-X

Reakcje katalizowane przez te enzymy oznaczają wewnętrzną reorganizację łączy, co może oznaczać zmiany w pozycji grup funkcjonalnych, w pozycji podwójnych wiązań między węglowodanami, bez zmian w wzorze molekularnym substratu.

Izomeraza wypełnia różne funkcje w różnych procesach biologicznych, w których można uwzględnić trasy metaboliczne, podział komórek, replikację DNA, aby wymienić kilka.

Izomeraza były pierwszymi enzymami wykorzystywanymi przez przemysłowo do produkcji syropów i innych słodkich żywności, dzięki ich zdolności do interpretacji izomerów różnych rodzajów węglowodanów.

Procesy biologiczne, w których uczestniczą izomeryki

Izomerazy uczestniczą w wielu niezbędnych procesach komórkowych. Do najbardziej widocznych są replikacja i opakowanie DNA, katalizowane przez topoizomerazy. Zdarzenia te są kluczowe dla replikacji kwasu nukleinowego, a także dla jego kondensacji przed podziałem komórki.

Glikoliza, jedna z centralnych dróg metabolicznych w komórce, zawiera co najmniej trzy enzymy izomerowe, a mianowicie: fosfoglukoza izomerazy, izomeraza triosa-fosforan i fosfoglikate mutasa.

Konwersja UDP-galaktozy w UDP-glukoza do ścieżki katabolizmu galaktozy osiąga działanie efemerazy. U ludzi ten enzym jest znany jako UDP-Glucosa 4-epimerasa.

Może ci służyć: Querétaro Flora i Fauna: Reprezentatywne gatunki

Składanie białka jest niezbędnym procesem funkcjonowania wielu enzymów w naturze. Enzym białko-białko izomeazy uczęszcza do fałdowania białka, które zawierają mosty disiarczkowe poprzez modyfikację ich pozycji w cząsteczkach stosowanych jako substrat.

Funkcje izomerów

Główna funkcja enzymów należących do klasy izomerazy można postrzegać jako transformacja substratu poprzez niewielką zmianę strukturalną, aby uczynić ją podatną na dalsze przetwarzanie przez enzymy poniżej drogi metabolicznej, na przykład.

Przykładem izomeryzacji jest zmiana grupy fosforanowej w pozycji 3 na węgiel w pozycji 2 3-fosfogliceryny, aby zamienić go w 2-fosfogliceniat, katalizowany przez mutazę fosfoglicerynianą enzymu w trasie glukolitycznej, która generuje związek o większej energii, który, który, który jest jest funkcjonalnym substratem enolasy.

Nomenklatura

Klasyfikacja izomeraz jest zgodna z ogólnymi zasadami klasyfikacji enzymów zaproponowanych przez komisję enzymatyczną (Komisja enzymatyczna) W 1961 r., W którym każdy enzym otrzymuje kod numeryczny do klasyfikacji.

Pozycja liczb w tym kodzie wskazuje każdą z podziałów lub kategorii w klasyfikacji, a liczby te są poprzedzone literami „EC”.

W przypadku izomerazy pierwszy problem reprezentuje klasę enzymatyczną, druga oznacza rodzaj wykonywanej izomeryzacji, a trzeci podłoże, na którym działają.

Nomenklatura klasy izomera jest EC.5. Ma siedem podklas, więc enzymy można znaleźć w kodzie z EC.5.1 do EC.5.6. Istnieje szósta „podklasowa” znana jako „inne izomerazy”, których kodem jest WE.5.99, ponieważ zawiera enzymy z różnymi funkcjami izomerami.

Może ci służyć: topoizomeraza: co to jest, cechy, funkcje, typy

Denotacja podklas odbywa się głównie według rodzaju izomeryzacji, którą wykonują enzymy. Mimo to mogą również otrzymywać nazwy takie jak rasury, epicease, CIS-trans-Izomerazy, izomerazy, tautomerazy, mutas lub cykl izomerazy.

Typy/podklazy izomerowe

Istnieje 7 klas enzymów w rodzinie izomeraft:

Ec.5.1 racemas i epimerasas

Katalizują tworzenie mieszanin rankingowych na podstawie pozycji węglowej α. Mogą działać na aminokwasy i pochodne (EC.5.1.1), w grupach i pochodnych wodoroksycidów (EC.5.1.2), na węglowodanach i pochodnych (EC.5.1.3) i inne (WE.5.1.99).

Ec.5.2 CIS-trans-Izomeraza

Katalizują konwersję między formami izomerycznymi Cis I trans różnych cząsteczek.

Ec.5.3 Izomy wewnątrzcząsteczkowe

Te enzymy są odpowiedzialne za izomeryzację części wewnętrznych w tej samej cząsteczce. Istnieją niektóre, które wykonują reakcje redukcji utleniaczy, w których akceptor dawcy i elektronów jest tą samą cząsteczką, więc nie są one klasyfikowane jako oksydorredyktazy.

Mogą działać, stając się aldose i ketosami (WE.5.3.1), na grupach keto- i enol- (EC.5.3.2), zmiana pozycji podwójnych łączy C-C (EC.5.3.3), łączy D-S-S (EC.5.3.4) i inne „oksydorreduktazy” (WE.5.3.99).

Ec.5.4 transfrazy wewnątrzcząsteczkowe (mutas)

Enzymy te katalizują zmiany pozycji różnych grup w tej samej cząsteczce. Są one klasyfikowane według rodzaju grupy, która „porusza się”.

Istnieją fosfomuty (EC.5.4.1), te, które przenoszą grupy aminowe (WE.5.4.2), te, które przenoszą grupy hydroksylowe (EC.5.4.3) oraz te, które przenoszą inne typy grup (WE.5.4.99).

Ec.5.5 liaz wewnątrzcząsteczkowych

Katalizują „eliminację” grupy, która jest częścią cząsteczki, ale nadal jest z nią kowalencyjnie powiązana.

Ec.5.6 izomerazy, które zmieniają konformację makrocząsteczkową

Mogą działać poprzez zmianę konformacji polipeptydów (EC.5.6.1) lub kwasy nukleinowe (EC.5.6.2).

Może ci służyć: flora i fauna Francji: główne gatunki

Ec.5.99 innych izomeraz

Ta podklasa gromadzi enzymy, takie jak izomeraza tiocyjanian i izomeraza 2-hydroksyny-2-karboksylanowa.

Bibliografia

1. Izomeraza. Zaczerpnięte z Britannica.com
2. Nelson, zm. L., & Cox, m. M. (2009). Lehninger Zasady biochemii. Omega Editions (Ed.).