Charakterystyka rybulosa, struktura i funkcje

Ribulosa Jest to cukier monosacharydowy lub węglowodan, który zawiera pięć atomów węgla i grupę funkcjonalną cetone w swojej strukturze, więc jest uwzględniony w grupie Ketopenticas.

Kościół czteroosobowy i pięć atomów węgla jest nazwany przez wstawienie infix ”Ul”W imieniu odpowiadającej Aldosa. Tak więc d-libulous to ketopentosa, która odpowiada d-libose, aldopentosa.

Projekcja Fishera dla Ribulosa (źródło: neurotoger [domena publiczna] za pośrednictwem Wikimedia Commons)

Ten cukier uczestniczy w formie D-Libulous jako pośrednik na różnych trasach metabolicznych, jak na przykład w cyklu Calvin. Podczas gdy samotnie w niektórych bakteriach gatunków, takich jak Acetobacter I Gluconobacter L-liboza jest uzyskiwana jako końcowy produkt metaboliczny. Z tego powodu te mikroorganizmy są używane do ich syntezy na poziomie przemysłowym.

Niektóre związki pochodzące z rybulozy mają główne związki pośrednie na drodze fosforanu pentozowego. Ta trasa ma na celu wygenerowanie NADPH, ważnego kofaktora, który działa w biosyntezy nukleotydowej.

Istnieją mechanizmy przemysłowe do syntezy L-libulous jako izolowanego związku. Pierwsza metoda izolacji, z którą uzyskano, składała się z metody izolacji lewenowej i kucy.

Pomimo wielkich postępów w metodach przemysłowych w zakresie syntezy i oczyszczania związków chemicznych, L-libulous nie jest uzyskiwany jako izolowany monosacharyd, uzyskujący w połączonych frakcjach L-Libose i L-erabinoin.

Metodą uzyskania najczęściej używanego dziś libulous jest oczyszczenie z gLuconobacte Frarateurii IFO 3254. Ten rodzaj bakterii jest w stanie przetrwać w warunkach kwaśnych i mieć drogę utleniania rybitolu do L-libulous.

Może ci służyć: sinaloa flora i fauna: bardziej popularne zwierzęta i rośliny

[TOC]

Charakterystyka

Ribulous jako zsyntetyzowany, ekstrahowany i oczyszczony odczynnik, który często występuje jako L-libulous, jest substancją stałą, białą i krystaliczną organiczną. Podobnie jak wszystkie węglowodany, ten monosacharyd jest rozpuszczalny w wodzie i ma typowe cechy substancji polarnych.

Jak to jest powszechne dla reszty sacharydów, rybuloza ma taką samą liczbę atomów węgla i tlenu, i dwukrotnie więcej w atomach wodoru.

Najczęstszym sposobem, w jaki można go znaleźć w naturze Ribulous w połączeniu z różnymi podstawnikami i tworzeniem złożonych struktur, ogólnie fosforylowanych, takich jak ribulous 5-fosforan, ribulous 1,5-bishfosforan, między innymi.

Związki te, zwykle działają jako pośredniki i transportery lub „pojazdy” dla grup fosforanowych w różnych komórkowych trasach metabolicznych, w których uczestniczą.

Struktura

Cząsteczka Ribulosa ma centralny szkielet pięciu atomów węgla i grupę Cetona w węglu w pozycji C-2. Jak wspomniano wcześniej, ta funkcjonalna grupa pozycjonuje ją w ketozach jako ketopentosa.

Ma cztery grupy hydroksylowe (-OH) zjednoczone z czterema węglemi, które nie są przymocowane do grupy ketonowej, a te cztery węgle są nasycone atomami wodoru.

Cząsteczkę rybakową można reprezentować zgodnie z projekcją Fishera w dwóch formach: d-libulous lub libulous, formą jest stereoizomer i enancjomer formy d i odwrotnie.

Klasyfikacja formy D lub L zależy od orientacji grup hydroksylowych pierwszego atomu węgla po grupie Cetona. Jeśli ta grupa jest zorientowana na prawą stronę, cząsteczka w imieniu Fishera odpowiada d-libulom, w przeciwnym razie znajduje się po lewej stronie (l-libulous).

Może ci służyć: jakie są różnice między fotosyntezy a oddychaniem?

W projekcji Hawortha rybuloza może być reprezentowana w dwóch dodatkowych strukturach w zależności od orientacji hydroksylu anomerycznego atomu węgla. W pozycji β hydroksyl jest zorientowany w kierunku górnej części cząsteczki; Podczas gdy pozycja α prowadzi hydroksyl w kierunku dna.

Zatem, zgodnie z projekcją Hawortha, można podjąć cztery możliwe sposoby: β-d-libulous, α-d-libulous, β-l-libuloza lub α-l-libulous.

Projekcja Haworth dla Ribulofuranosa (źródło: Neurotokeker [domena publiczna] za pośrednictwem Wikimedia Commons)

Funkcje

Szlak fosforanu pentozowego

Większość komórek, zwłaszcza te, które występują w szybkim i stałym podziale, takie jak ślepy kostne, błona śluzowa jelit i komórki nowotworowe, stosuje ribulous-5-fosforan, który jest izomeryzowany do rybozy-5-fosforanu na ścieżce oksydacyjnej fosforanu pentozowego , do wytworzenia kwasów nukleinowych (RNA i DNA) i koenzymów, takich jak ATP, NADH, FADH2 i Coenzima A.

Ta faza oksydacyjna fosforanu pentozowego obejmuje dwa utleniania, które przekształcają 6-fosforan glukozę na 5-fosforan rybulozy, zmniejszając NADP+ do NADPH.

Dodatkowo aktywnie aktywny fosforan Ribulosa-5.

Calvin Cycle

Cykl Calvin to cykl fiksacji węgla, który ma miejsce w organizmach fotosyntetycznych po pierwszych reakcjach fotosyntezy.

Udowodniono go przez oznaczenie metod w próbach przeprowadzanych przez różnych badaczy, które oznaczając węgiel w pozycji C-1 rybulosa-1,5-bifosforanu, dwutlenku węgla jest ustawione w tym pośredniku podczas pochodzenia cyklu Calvin na dwa Cząsteczki 3-fosfoglikanu: jeden oznaczony i jeden bez oznakowania.

Rubisco (karboksylaza/tlenka o tlenku Rubisco 1,5-bishoposforan) jest uważana za najliczniejszy enzym planety i wykorzystuje jako podłoże Ribulous 1,5-bishosforan, w celu katalizowania włączenia dwutlenku węgla i produkcji 1,3-difoglikatu w cyklu kalinowym w cyklu kalinowym Calvin.

Może ci służyć: lipaza: karakateriała, struktura, typy, funkcje

Zerwanie tego niestabilnego pośredniego, 1,3-diffoglikatu, sześciu atomów węgla, jest również katalizowane przez Rubisco, które jest tym, które pośredniczy w tworzeniu dwóch cząsteczek 3 atomów węgla (3-fosfoglikanu).

Funkcje w bakteriach

ENOL-1-ALBO-Karboksyfenylam. Na tym etapie uwalniana jest cząsteczka dwutlenku węgla i jedna z wody, wytwarzając również cząsteczkę indol-3-glicerol-fosforan.

Bakterie używają L-Libulous również na trasach stosowanych do metabolizmu etanolu. Ponadto, te mikroorganizmy mają enzym znany jako izomeraza L-arabinna, która modyfikuje arabinę do syntezy L-libulous.

L-libuloza quinasa fosforyla Ten metabolit poniżej utworzenia l-5-fosforanu, który może wejść na ścieżkę fosforanu pentozowego do produkcji cukrów szkieletów kwasów nukleinowych i innych niezbędnych cząsteczek.

Bibliografia

1. Ahmed, Z. (2001). Produkcja naturalnych i rzadkich pontonów z użyciem mikroorganizmów i ich enzymów. Electronic Journal of Biotechnology, 4(2), 13-14.
2. Ahmed, Z., Shimonishi, t., Buiyan, s. H., Utamura, m., Takada, g., I Izumori, K. (1999). Biochemiczne przygotowanie L-Libose i L-Yarabinoza z rybitolu: nowe podejście. Journal of Bioscience and Bioingineering, 88(4), 444-448
3. Finch, str. (Ed.). (2013). Węglowodany: struktury, synteza i dynamika. Springer Science & Business Media.
4. Murray, r., Bender, d., Botham, k. M., Kennelly, s. 1. J., Rodwell, v., I Weil, p. DO. (2012). Harpers ilustrowany biochemia 29/e. Ed Mc Graw Hill Lange, Chiny
5. Nelson, zm. L., Lehninger, a. L., & Cox, m. M. (2008). Zasady biochemii lehninger. Macmillan.
6.  Stick, r. V. (2001). Węglowodany: słodkie cząsteczki życia. Elsevier.