Charakterystyka genotyp, standard reakcji, determinacja

On genotyp Jest zdefiniowany jako zestaw genów (z ich allelami), które kodują one dla konkretnej funkcji lub charakterystyki, które odróżniają się od innych przez określoną funkcję lub sekwencję. Jednak niektórzy autorzy definiują to również jako część genomu, która powoduje powstanie fenotypu lub jako allelicznej konstytucji organizmu.

Chociaż genotyp i fenotyp terminy nie są tym samym. W tym sensie fenotyp jest zdefiniowany jako zestaw widocznych cech organizmu, który jest wynikiem ekspresji jego genów, a także genotypu jako zestawu genów, które powodują określony fenotyp.

Genotyp i fenotyp (źródło: National Human Genome Research Institute [domena publiczna] za pośrednictwem Wikimedia Commons) Genotyp jest tylko jednym z czynników związanych z ustaleniem fenotypu, ponieważ wpływ środowiska i innych elementów epigenetycznych, które nie są bezpośrednio powiązane do sekwencji nukleotydowej uformuje również widoczne cechy osobników.

Zatem dwa organizmy mają ten sam genotyp, jeśli mają one te same zestawy genów, ale to samo nie dotyczy dwóch organizmów, które najwyraźniej mają ten sam fenotyp, ponieważ podobne cechy mogą być wynikiem różnych genów.

To duński botanik Wilhelm Johansen w 1909 r., Który po raz pierwszy wprowadził do nauki genotyp i fenotyp, w podręczniku, który zatytułowany „zatytułowany”Elementy teorii o dokładnym dziedziczeniu ”, który był produktem serii eksperymentów, które przeprowadzały czyste linie jęczmienia i groszku.

Jego prace, prawdopodobnie zainspirowane przez kilka lat wcześniej przez Gregorio Mendel, uważane za "Ojciec genetyki”, Pozwolił mu wyjaśnić, że genotyp organizmu powoduje powstanie fenotypu poprzez różne procesy rozwoju i pod wpływem środowiska.

[TOC]

Charakterystyka

Genotyp nie jest dokładnie taki sam jak genom. Oto rozróżnienie obu koncepcji:

- „Genom” odnosi się do wszystkich genów, które dana osoba odziedziczyła po rodzicach i ich rozmieszczenia w chromosomach w jądrze.

- „Genotyp” to termin używany w odniesieniu do zbioru genów i ich wariantów, które powodują określoną cechę, że jednostka wyróżnia się w populacji lub gatunku.

Chociaż jest podatny na zmiany spowodowane mutacjami w całej historii organizmu, genotyp jest stosunkowo niezmienną cechą jednostek, ponieważ teoretycznie geny, które są odziedziczone, są takie same od poczęcia do śmierci.

W naturalnej populacji allele, które składają się na dany genotyp, mają różne częstotliwości wyglądu; Oznacza to, że niektóre pojawiają się w populacjach bardziej niż inne, a to dotyczy niektórych rzeczy, z dystrybucją, warunkami środowiskowymi, obecnością innych gatunków itp.

Termin „genotyp dziki„Definiuje pierwszy wariant alleliczny znaleziony w naturze, ale niekoniecznie odnosi się do allelu występującego częściej w populacji; oraz termin „genotyp Mutant„Obecnie jest używany do zdefiniowania tych alleli odmiennych od Wild.

Aby napisać genotyp, zwykle używane są litery kapitałowe i małe litery, aby rozróżnić allele, które ma osoba, zarówno homozygotyczna, jak i heterozygotyczna. Litery kapitałowe służą do definiowania dominujących i małych alleli dla recesji.

Reguła reakcji genotypu

Osoby odziedziczą geny rodziców, ale nie na produkty końcowe, które są uzyskiwane z ich ekspresji, ponieważ zależą od wielu czynników zewnętrznych i historii ich rozwoju.

Zgodnie z tym i odnosząc się tylko do czynników środowiskowych, genotyp może prowadzić do więcej niż jednego fenotypu. Zestaw możliwych „wyników” interakcji określonego genotypu z różnymi środowiskami jest tym, co naukowcy nazywali „zasadą reakcji genotypu”.

Normą reakcji genotypu jest zatem rodzaj „kwantyfikacji” lub rejestracji widzialnych cech uzyskanych z interakcji genotypu z niektórymi środowiskami. Można go wyrazić jako grafikę lub tabele, które „przewidują” możliwe wyniki.

Oczywiście jest oczywiste, że standard reakcji odnosi się tylko do częściowego genotypu, częściowego fenotypu i kilku czynników środowiskowych, ponieważ w praktyce bardzo trudno jest przewidzieć absolutnie wszystkie interakcje i wszystkie wyniki ich.

Jak określa się genotyp?

Określ genotyp lub „genotypify” organizmu lub populacji osób z tego samego gatunku, zapewnia wiele cennych informacji na temat jego biologii ewolucyjnej, biologii populacji, taksonomii, jego ekologii i różnorodności genetycznej.

W mikroorganizmach, takich jak bakterie i drożdże, ponieważ mają wyższe wskaźniki mnożenia i mutacji niż większość organizmów wielokomórkowych, określanie i znajomość genotypu pozwala kontrolować tożsamość kolonii w zbiorach, a także ustanowienie pewnych cech epidemiologii, ekologii i taksonomii tego samego.

Aby ustalić genotyp, konieczne jest uzyskanie próbek organizmu, z którym chcesz pracować, a niezbędne typy próbek będą zależeć od każdego organizmu. Na przykład u zwierząt można pobrać próbki różnych tkanek: ogon, uszy, kał, włosy lub krew.

Genotyp organizmu można określić eksperymentalnie dzięki zastosowaniu niektórych nowoczesnych technik, które będą zależeć od genomowej lokalizacji genów do badania, budżetu i czasu, łatwości użytkowania oraz pożądanego stopnia wydajności.

Obecnie techniki zastosowane do genotipifikacji organizmu obejmują: bardzo często stosowanie i analiza markerów molekularnych do wykrywania polimorfizmów w DNA i innych bardziej zaawansowanych technikach, które sugerują sekwencjonowanie genomu.

Więcej markerów pracowników

Wśród najczęściej używanych markerów znajdujemy następujące:

- RFLP (polimorfizmy fragmentów restrykcyjnych).

- AFLP (wzmocnione polimorfizmy długości).

- RAPD (losowo wzmocniony polimorficzny DNA).

- Mikrosatelity lub SSR (powtarzana prosta sekwencja).

- ASAPS (startery związane z określonymi allelami).

- SNP (proste polimorfizmy nukleotydowe).

Techniki wykorzystujące sekwencjonowanie i hybrydyzację

A wśród technik wykorzystujących określone sekwencjonowanie i hybrydyzację określonych sond są:

- Sekwencjonowanie metodą Sanger.

- Genotipifikacja o wysokiej wydajności.

- Próba "Złota Brama„Z Illumina.

- Genotipifikacja sekwencjonowania (GBS).

- Esej Taqman.

- Sekwencjonowanie nowej generacji.

- Mikromonarzerze.

- Pełne sekwencjonowanie genomu.

Bibliografia

1. Griffiths, a., Wessler, s., Lewontin, r., Gelbart, w., Suzuki, zm., & Miller, j. (2005). Wprowadzenie do analizy genetycznej (8 wyd.). Freeman, w. H. & Firma.
2. Klug, w., Cummings, m., I Spencer, C. (2006). Pojęcia genetyki (8 wyd.). New Jersey: Pearson Education.
3. Kwok, s.-I. (2001). Metody genotypowania polimorfizmów pojedynczych nukleotydów. Annu. Obrót silnika. Genomika szum. Genet., 2(11), 235-258.
4. Mahner, m., & Kary, m. (1997). Czym dokładnie są genomy, genotypy i fenotypy? A co z fenomami ? J. Teoria. Biol., 186, 55-63.
5. Mueller, u. G., & Wolfenbarger, L. L. (1999). Genotypowanie i odciski palców AFLP. Drzewo, 14(10), 389-394.
6. National Institute of Health. Pobrano 14 maja 2019 r. Z WWW.Nih.Gov/
7. Patel, zm. DO., Zander, m., Dalton-Morgan, J., & Batley, J. (2015). Postępy w genotypowaniu roślin: gdzie zabierze nas przyszłość. W J. Batley (red.), Genotypowanie roślin: metody i protokoły (Tom. 1245, s. 1-11). Nowy Jork: Springer Science + Business Media, Nowy Jork.
8. Pierce, ur. (2012). Genetyka: podejście koncepcyjne. Freeman, w. H. & Firma.
9. Schleif, r. (1993). Biologia genetyka i molekularne (2 wyd.). Maryland: The Johns Hopkins University Press.
10. Tümmler, ur. (2014). Metody genotypowania. W. Filloux i J. L. Ramos (red.), Metody w biologii molekularnej (Tom. 1149, s. 33-47). Nowy Jork.
11. Yang, w., Kang, x., Yang, q., Lin i., & Fang, m. (2013). Przegląd opracowywania metod genotypowania do oceny różnorodności zwierząt rolnych. Journal of Animal Science and Biotechnology, 4(2), 2-6.